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                    科研進展

                    武漢病毒所構建全球蟲媒病毒與節肢動物特異性病毒綜合信息數據集

                    來源: 時間:2023-05-22

                          吸血節肢動物中傳播循環的病毒有兩大類:蟲媒病毒(arbovirus)和節肢動物特異性病毒(arthropod-specific virus, ASV)。蟲媒病毒能在脊椎動物和節肢動物中復制,對人類或動物具有致病性,給全球公共衛生帶來沉重負擔。節肢動物特異性病毒僅在節肢動物中復制,它們可能是蟲媒病毒進化的起源。然而,目前沒有涵蓋所有已知蟲媒病毒和節肢動物特異病毒種類、生物安全風險等級、基因組節段、地理分布等信息的綜合數據集。

                          2023年5月19日,國際學術期刊Scientific Data在線發表了武漢病毒所/生物安全大科學中心袁志明/夏菡團隊在蟲媒病毒生態健康和生物安全領域的最新研究論文,文章題為“A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus”(全球蟲媒病毒和節肢動物特異病毒的序列、多樣性及生物安全風險綜合數據集)。研究人員通過整合美國CDC蟲媒病毒名錄(Arbovirus Catalog)、第六版《微生物和生物醫學實驗室生物安全》(BMBL 6th)附錄VIII-F、國際病毒分類委員會(ICTV)的病毒分類信息以及Genbank序列等有關信息,提取分類學、生物安全風險、基因節段、核酸和氨基酸序列、地理分布等信息,構建了首個全球蟲媒病毒和節肢動物特異病毒的綜合數據集。

                          該數據集包含了615個蟲媒病毒(460個病毒種)、98,994條記錄和190個節肢動物特異病毒(180個病毒種)、2,100條記錄,涉及34個病毒科、89個病毒屬和640個病毒種(圖1a)。本研究詳細展示了蟲媒病毒和節肢動物特異病毒間的基因組節段差異(圖1b)、生物安全風險建議等級(圖1c)、病毒及其節肢動物媒介的全球分布、宿主來源等特征(圖1d)。為深入理解蟲媒病毒和節肢動物特異病毒的相互作用、進化規律和風險評估提供了豐富的數據資源(圖2)。

                          武漢病毒所博士后黃英、博士研究生汪順龍和山東理工大學副教授劉紅為論文共同第一作者,武漢病毒所夏菡青年研究員和浙大城市學院明朝燕副教授為論文共同通訊作者,武漢病毒所袁志明研究員、美國德州大學醫學分部Sergio Rodriguez助理教授為該項研究的合作作者。該研究得到國家重點研發計劃項目、國家自然科學基金項目和中科院中非中心項目等項目的資助。

                     

                    圖1. 蟲媒病毒和節肢動物特異病毒的分類、基因組節段和生物安全分級建議和宿主來源 

                     

                     

                     

                    圖2. figshare數據集部分信息 

                     

                    文章鏈接:

                    https://www.nature.com/articles/s41597-023-02226-8

                    數據鏈接:

                    https://figshare.com/articles/dataset/A_global_dataset_of_viral_sequence_diversity_and_distribution_of_arboviruses_and_arthropod-specific_viruses/22154573?file=40281991

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